上海交通大学中国公益发展研究院前身是2006年成立的上海交通大学第三部门研究中心，上海交通大学国际与公共事务学院徐家良教授任院长。研究方向：社会组织、慈善事业、基层治理、社会企业、社会创新、政府购买公共服务。

自成立以来，研究院在学术科研、政策咨询等方面硕果累累。

多次获批国家社会科学基金重大项目：2014年“全面深化改革中政府购买公共服务制度化研究”，2017年“促进中国慈善事业发展的法律制度创新研究”，2020年“慈善组织的治理和监督机制研究”，2025年“中国基层治理创新的典型案例和成效评价研究”。

对《中华人民共和国慈善法》、《中华人民共和国境外非政府组织境内活动管理法》的制定和社会组织三大条例（《社会服务机构登记管理条例》、《基金会管理条例》、《社会团体登记管理条例》）的修改提出过相应的专家政策建议。

2011年起，定期出版《中国社会组织研究》（原名“《中国第三部门研究》”）集刊，已出版30卷。该刊于2017年进入中文社会科学引文（CSSCI）来源集刊目录，2019年至2022年连续被社会科学文献出版社评为优秀集刊，2022年、2025年入选社会科学文献出版社CNI名录集刊，2023年被中国社会科学评价研究院评定为“2022年度中国人文社会科学期刊AMI综合评价”集刊入库期刊。研究院2013年至2019年每年与民政部社会组织服务中心联合发布社会组织蓝皮书《中国社会组织评估发展报告》，2018年发布社会组织蓝皮书《中国社会智库发展报告》，2021年、2023年发布社会企业蓝皮书《中国社会企业发展研究报告》。

研究院2014年成为民政部社会组织与社会建设研究基地，2016年成为民政部全国社会组织教育培训基地、2019年成为民政部政策理论研究基地；同时也是“十三五”上海民政科研基地、“十四五”上海民政科研基地、上海公益基地。入选上海高校智库内涵建设计划，是中国首批智库索引（CTTI）来源智库，被中国社会科学评价研究院评为“中国核心智库”、“2025年AMI智库入库单位”。